驯养的菥蓂

flowchart showing how a new pennycress reference genome was developed

亚洲城娱乐 食品,农业和国家资源科学学院 (CFANS),合作与 我们。农业部农业研究服务部已经创建了一个名为程序 永远的绿色倡议,这是专门为开发经济上有价值的作物,这将改善土壤和水的质量。研究人员永远的绿色正在调查各种农作物,可以越冬的其他未使用的耕地和有经济效益和生态效益的。

这些作物之一是菥蓂,冬季耐寒油籽作物覆盖,可以用季节性大豆和玉米交替。目前,菥蓂是具有若干不希望的特征,包括不均匀的萌发,小种子,和心皮的倾向收获前粉碎的未驯化的植物。通过消除这些特性来创建各种驯养菥蓂的,它可以变成一种经济作物。这将是种植在秋季,玉米或大豆收获后,并在冬季提供土壤保护。在春天,菥蓂重新开始增长。它的种子提供了可用于先进生物燃料的油,从而提供了大豆和玉米农民额外收入。永远的绿色研究小组最近开发了食用油和豆粕及用于食品和饲料产品的使用开辟了新的途径菥蓂线。

3个微星PIS是谁正在使用MSI为菥蓂研究永远的绿色研究人员:

博士后研究员博士。凯瑟琳frels,谁使用MSI作为教授安德森的MSI集团的一部分,在提交了一份海报 2019微星研究展 有关菥蓂项目。博士。 frels的海报中描述的遗传研究的研究人员进行的工厂。在海报中描述的工作,生物信息学分析都完成了微星的超级计算机,和微星存储测序数据的10 TB的只是菥蓂项目。从这个项目中一个有前途的发现是,利用新一代测序技术,微星的计算资源以及自定义生物信息学管道和软件,菥蓂可以在不到十年的时间比大多数植物驯化家养快,相当。您可以在这里查看海报: 解锁菥蓂潜力:通过生物信息学和超级快速驯化.

其他几个微星PIS是永远的绿色计划,做研究其他可能的覆盖作物的一部分。永远的绿色方案还与合作伙伴 g.e.m.s.,下一代agroinformatics数据发现和分析平台,通过在MSI CFANS和程序员农业专家研制。有关MSI的参与,详情请见微星网站上: g.e.m.s.平台.

图片描述: 新的菥蓂参考基因组的发展。基准线mn106进行长和短读测序技术来开发的组合组件。遗传图谱和接近测序(HI-C)将被用于开发支架和订购基因组中。初步分析表明,2.0版覆盖315周的支架433 MB相比,覆盖369 MB在支架6700的基因组草图。菥蓂基因组2.0将允许更有效的基因的发现和提高的全基因组分析。图像和描述从兆frels等人,“解锁菥蓂潜力:通过生物信息学和超级快速驯化”。(海报,MSI 2019研究展,明尼阿波利斯,明尼苏达州,2019年4月16日)。

张贴在2019年10月28日

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